故事承接第一部结尾，自从森林王子莫格利（海利·乔·奥斯蒙 Haley Joel Osment配音）没有人知道自从陈源6岁的时候，侯飞鹰出现过一次之后，陈秋树和冯芳商量了一夜，终于决定恢复冯芳的武功。冯芳的武功当初有多高？从她的大哥放心让她去陈家伺机偷盗狂龙三十六掌的秘笈就可以猜到一些了。认识了人类女孩珊迪（梅·惠特曼 Mae Whitman配音），便随她一同居住在人类村庄中。然而离开丛林生活的莫格利，却在新的环境里异常想念他的动物朋友们，尤其是待他非常好的黑熊巴洛（约翰·古德曼 John Goodman配音）。来自远方森林的召唤，让莫格利决定重新回到森林的怀抱中去。然而从前自由自在的森林生活，此刻却变得危机重重。老冤家老虎希瑞·坎（托尼·杰伊 Tony Jay配音）正在酝酿一场复仇计划。
